賞鯨業快速發展，就經濟面而言令人歡欣，但對長遠的保育與經營並不一定是件好事。人類的賞鯨活動對海上鯨豚的生活，無可避免的會造成一定程度的干擾，因此以觀賞為主的海上賞鯨，必須嚴苛的以不干擾鯨豚生活權利為最高準則。業者若沒有永續經營的理念，一昧大量干擾，現在蓬勃發展的現象將有可能只是曇花一現。目前有研究發現，過多的賞鯨船及賞鯨人潮，對鯨豚們生態產生了不少的影響，往年花蓮海域經常出現的瑞氏 (花紋) 海豚，近幾年的目擊率劇降，而其他種類的鯨豚目擊率也有下降趨勢。

　除了業者的經營影響外，遊客賞鯨的基本態度也很重要，若遊客抱持著「看馬戲團表演秀」的心態，含意深遠的生態旅遊即被扭曲成膚淺無知的海上之旅。希望賞鯨業能以強調生態旅遊為重點，讓民眾由衷感受到尊重海洋生物、以及保護海洋資源的重要性，間接地更為尊重漁民及相關業者的用心。正因為如此，業者提供的解說品質相當重要，若能在賞鯨解說時加以介紹沿岸陸地生態、漁港漁村文化及鯨豚知識，結合海洋文化與保護海岸的資訊，將可使賞鯨活動變得更為多元與豐富。

　但傳統漁業與鯨豚保育的衝突並未因此消弭，相較於社會大眾，靠海吃飯的漁民們對於鯨豚有著不一樣的看法，因為鯨豚捕食的目標物種常和漁民的目標漁獲相近、甚至重疊，漁民辛苦捕獲的魚類往往被鯨豚所食，因此損失慘重的漁民對鯨豚不免心生怨恨。為維護臺灣賞鯨的永續發展，社會大眾仍需團結，齊心努力改善。

資料來源
台灣的自然資源與生態資料庫－農林漁牧
(行政院農業委員會林務局　發行、國立臺灣大學生物多樣性研究中心　製作)